Юрий Петрович Трегубенков родился 18 августа 1953 г. в посёлке Любахна Дядьковского района Брянской области. Русский.
Окончил Борисоглебское высшее военное авиационное училище летчиков им. В.П. Чкалова (1975).
Начал службу в Белоруссии.
После окончания в 1988 г. с отличием академии Национальной народной армии им. Ф. Энгельса в ГДР назначен командиром авиационного полка в г. Луцке.
С 1991 г. проходил службу в Забайкальском военном округе.
В 1993 г. — командир авиационной дивизии.
Окончил Академию Генерального штаба ВС РФ в 1998 году, Центр подготовки летчиков-испытателей ГЛИЦ в Ахтубинске в1999 г.
В 1998 г. назначен заместителем начальника Государственного лётно-испытательного центра Министерства обороны РФ им. В.П. Чкалова.
С 1999 по 2008 г. — начальник Государственного лётно-испытательного центра им. В.П. Чкалова.
В 2008 г. по достижении предельного возраста уволен в запас Вооруженных Сил РФ.
С 2009 г. — советник исполнительного директора ОАО "ОКБ Сухого".
Заслуженный военный летчик Российской Федерации,
Генерал-полковник
Летчик-испытатель 1-го класса. Освоил более 40 типов самолетов и их модификаций. Налетал более 3000 часов. Под его руководством и при непосредственном участии приняты на вооружение авиакомплексы Су-27ИБ, Су-27СМ, Су-25СМ, Су-24М2, Ми-28Н, Як-130 и др.
Указом Президента Российской Федерации от 25 мая 2000 г. генерал-лейтенанту Трегубенкову Юрию Петровичу присвоено звание Героя Российской Федерации.
Участник боевых действий.
Государственные награды:
Золотая Звезда Героя Российской Федерации
орден "За заслуги перед Отечеством" IV степени,
орден Красной звезды
орден "За службу Родине в Вооруженных Силах СССР" III степени