Митрополит Ионафан (Елецких), в миру - Анатолий Иванович Елецких) родился 30 января 1949 года в с. Шаталовка Воронежской области в семье офицера. Русский.
Детство и первые школьные годы жил с родителями в г. Североморске Мурманской области.
1061 г. - отца перевели в Киевский военный округ
Тайно принял крещение в Киеве.
1966 г. - окончил школу
1966-1968 гг. - срочная военная служба
1970 г. - поступил в Ленинградскую духовную семинарию
1973-1976 гг. - учился в Ленинградской духовной академии, обучаясь одновременно в регентском классе. Занимался пением, посещал репетиционный зал Академической капеллы имени Глинки. Сблизился с художниками-авангардистами Сергеем Спицыным и Татьяной Глебовой, высоко ценившей его музыкальное дарование. Посещал выставки, организуемые Глебовой в её мастерской (что в те времена считалось опасным).
5 апреля 1977 г. митрополитом Ленинградским и Новгородским Никодимом (Ротовым) пострижен в монашество с именем Ионафан. 16 апреля тем же иерархом рукоположён в сан иеродиакона.
В 1978 году епископом Выборгским Кириллом (Гундяевым), ректором Ленинградской духовной академии, был рукоположён в иеромонаха.
Окончил академию со степенью кандидата богословия и был оставлен профессорским стипендиатом. Несколько лет преподавал церковное пение в семинарии и в регентском классе, а также нёс послушание регента хора Ленинградских духовных школ. В 1986 году этот хор под его управлением осуществил запись грампластинки, где впервые были озвучены авторские произведения Ионафана.
В декабре 1986 года был вызван в КГБ в связи с распространением среди семинаристов книги "Архипелаг ГУЛАГ" Александра Солженицына и лишён временной ленинградской прописки. В течение года не мог найти нового места служения из-за препятствий, которые чинил КГБ.
С весны 1987 года по июнь 1988 года — клирик киевского кафедрального Владимирского собора.
В июне 1988 года становится насельником Киево-Печерской Лавры, часть которой (Дальние пещеры) была возвращена Церкви в связи с празднованием 1000-летия Крещения Руси.
23 июля 1988 года назначен исполняющим обязанности наместника Лавры.
11 октября 1988 года патриархом Пименом возведён в сан архимандрита и 12 октября благословением патриарха Пимена утверждён в должности наместника Киево-Печерской Лавры, о чём был выдан соответствующий указ Патриаршего экзарха митрополита Киевского и Галицкого Филарета (Денисенко).
Постановлением патриарха Пимена и Священного Синода от 10 апреля 1989 года и по рекомендации митрополита Филарета (Денисенко) определено быть епископом Переяслав-Хмельницким, викарием Киевской епархии.
23 апреля 1989 года во Владимирском соборе Киева был хиротонисан во епископа сонмом архиереев во главе с митрополитом Филаретом (Денисенко).
В 1990 году назначен управляющим делами Украинского Экзархата.
Стал в жёсткую оппозицию митрополиту Киевскому Филарету (Денисенко), активно выступая против его курса на отделение от Московского Патриархата. Постановлением Синода Украинской Православной Церкви от 23 апреля 1991 года был запрещён в священнослужении сроком на 3 года.
С 1991 по 1992 год находился без места служения.
3 июня 1991 года подал рапорт-апелляцию Патриарху Алексию II, в котором отверг сфабрикованные обвинения в свой адрес и выдвинул встречные обвинения против митрополита Филарета (Денисенко).
В сентябре 1991 года на заседании Синода УПЦ МП под давлением председательствующего митрополита Филарета был лишён сана "за нераскаянность".
В апреле 1992 года создал в Киеве "Комитет духовенства и мирян в защиту Православия".
После избрания митрополита Владимира (Сабодана) предстоятелем УПЦ МП постановлением Священного Синода УПЦ МП лишение сана было признано не имеющем канонических оснований и потому недействительным.
С декабря 1992 года — епископ Белоцерковский, викарий Киевской епархии.
С 22 июня 1993 года по июль 2000 года — вновь управляющий делами УПЦ (МП), член и секретарь Священного Синода УПЦ (МП) — по должности.
С 29 декабря 1993 года — епископ Глуховский и Конотопский.
28 июля 1994 года предстоятелем УПЦ (МП) митрополитом Киевским Владимиром (Сабоданом) удостоен сана архиепископа.
С 27 августа 1995 года — архиепископ Сумский и Ахтырский.
С 30 марта 1999 года — архиепископ Херсонский и Таврический.
С 22 ноября 2006 года — архиепископ Тульчинский и Брацлавский.
28 августа 2014 года в Успенском соборе Киево-Печерской лавры митрополитом Киевским и всея Украины Онуфрием (Березовским) возведён в сан митрополита.
11 октября 2022 года Службой безопасности Украины в его доме был проведён обыск; сообщалось, что оперативные мероприятия проводятся в рамках уголовного производства, открытого по статье 161 Уголовного кодекса Украины (нарушение равноправия граждан в зависимости от их расовой, национальной принадлежности, религиозных убеждений, инвалидности и других признаков)
12 октября 2022 г. - владыка опубликовал заявление: "улики, якобы найденные в данных помещениях никакого отношения ни ко мне, ни к Тульчинской епархии не имеют"
7 августа 2023 г. - приговорен к 5 годам лишения свободы Винницким городским судом. По версии следствия, Ионафан распространял среди прихожан пророссийские листовки, а также разместил на сайте епархии статью, в которой заявлял о главенстве Московского патриархата
22 июня 2024 года по ходатайству патриарха Московского и всея Руси Кирилла был освобождён
Духовный композитор, переводчик литургических и духовных текстов. Автор церковных сочинений и переложений духовных песнопений, вошедших в сборники "Христос рождается" (1993), "Степенные антифоны утрени" (1994) и "Православные церковные хоры" (1995). Часть сочинений и переложений записана на компакт-диск "Традиционные и новые песнопения Православной Церкви", где звучит соло живой голос автора и дирижёра ("С нами Бог" соловецкого напева, "Тело Христово" знаменного распева, "Хвалите имя Господне" валаамского напева). Некоторые другие духовно-музыкальные сочинения архиепископа Ионафана были опубликованы и записаны на компакт-диски разными хоровыми коллективами: "Степенные антифоны древних напев", "Чертог Твой" (до минор), "Плотию уснув" (ля минор), "Ныне силы небесные", валаамский напев, "С нами Бог", соловецкий напев, (соль минор), "Покаяния отверзи ми двери" зн.р. (Си-бемоль мажор), "Величит душа Моя Господа" (ре минор) и др. Был издан компакт-диск с звукозаписью авторской "Литургии Мира", в которой гимны православной Литургии св. Иоанна Златоуста были распеты на мелодии григорианского хорала. Позднее была записана т. н. "Чернобыльская литургия", посвященная памяти жертв техногенной катастрофы на Чернобыльской АЭС (Украина) — в авторской хоровой версии, и, в сотрудничестве с композитором Валерием Рубаном, — с оркестровым сопровождением. Последняя версия неоднократно исполнялась в годовщину трагедии в престижных концертных залах Украины и России.
Автор ряда статей, которые публиковались в церковной печати на Украине и за рубежом. В 2003 году "метроритмически" и в прозе переложил на русский язык духовную поэму VII века — Великий покаянный канон св. Андрея Критского (впервые опубликована издательством Херсонского Государственного Университета при содействии его ректора профессора Юрия Беляева).
В 2004 году издательство Херсонского Государственного Университета выпустило нотный сборник архиепископа Ионафана "Осанна", в который вошли его духовно-музыкальные переложения, оригинальные сочинения, патриотические гимны и стихи, с включением в него малоизвестных хоровых концертов В. Фатеева, ученика Римского-Корсакова.
В этом же университетском издательстве впервые был напечатан популярный "Толковый путеводитель по молитвословиям Божественной Литургии святителей Иоанна Златоуста и Василия Великого" с опытом изложения молитвословий и ектений Литургии на русском и украинском языках, с обширным и доступным для понимания историко-богословским комментарием и рядом евхаристологических статей известных богословов и учёных-литургистов (обновлённая оригинальная редакция 2017 года)
Государственные награды России:
орден Дружбы (2009), за большой вклад в развитие сотрудничества между Российской Федерацией и Украиной
Государственные награды Украины:
орден "За заслуги" III степени (2012) — за весомый личный вклад в социально-экономическое и культурно-образовательное развитие Винницкой области, значительные профессиональные достижения, многолетний добросовестный труд и по случаю 80-летия образования области
Награды Русской Православной Церкви:
Орден Святого равноапостольного великого князя Владимира II степени — во внимание к трудам и в связи с 60-летием
Орден святого благоверного князя Даниила Московского II степени
Орден преподобного Сергия Радонежского II степени (2004 год) — за большие заслуги перед Православной Церковью и в связи с 55-летием со дня рождения
Орден преподобного Серафима Саровского II степени (2014 год) — во внимание к усердным архипастырским трудам и в связи с 65-летием со дня рождения и 25-летием архиерейской хиротонии
медаль в память 200-летия победы России над французами в Отечественной войне 1812 года (2013)
Орден преподобных Антония и Феодосия Печерских I степени (УПЦ)
Орден святого апостола Иоанна Богослова ІІ степени (2009) — во внимание к церковным заслугам и в связи с 60-летием (УПЦ)
Орден святого апостола Андрея Первозванного (2014) — во внимание к церковным заслугам и в связи с 65-летием (УПЦ)
Орден Святого Стефана Великого (Православная Церковь Молдовы, 2010 год)
Награды других Православных Церквей:
Медаль святого апостола и евангелиста Марка (Блаженнейший Патриарх Иерусалимский Диодор, Иерусалимская православная церковь)
Прочие награды:
Орден "За выдающиеся достижения в музыкальном искусстве" — Национальная музыкальная академия Украины имени П. И. Чайковского, 2011 год.