Анатолий Иванович Якунин родился 11 февраля 1964 года в селе Кривцово-Плота Должанского района Орловской области. Русский.
Служил в Вооруженных Силах.
Окончил Академию МВД России, Академию государственной службы при Президенте РФ.
Службу в милиции начинал в Должанском районном отделе внутренних дел участковым инспектором.
Прошёл путь сотрудника и руководителя милицейских подразделений районного и областного уровня, в том числе, занимал должности начальника отдела внутренних дел, начальника управления по борьбе с организованной преступностью и первого заместителя начальника УВД – начальника криминальной милиции УВД по Орловской области.
2008 - июнь 2010 гг. - первый заместитель начальника ГУВД – начальник криминальной милиции ГУВД по Воронежской области.
14 июня 2010 - 2 июня 2012 гг. - начальник УВД по Новгородской области
С 2 июня 2012 г. - начальник Главного управления МВД России по городу Москве
Генерал-майор (10 ноября 2009)
Государственные награды МВД:
медаль "За отличие в охране общественного порядка"
