Митрофан Яковлевич Студеникин родился 2 декабря 1923 года в селе ЛистопадовкаВоронежской области.
Отец - Студеникин Яков Федотович (1898-1984).
Мать - Студеникина Прасковья Илларионовна (1901-1978).
Окончив среднюю школу, сразу же ушел на фронт и прошел всю войну в действующей армии, был дважды ранен.
После демобилизации поступил во II Московский ордена Ленина медицинский институт имени Н.И. Пирогова (ныне - Российский государственный медицинский университет) и окончил его с отличием в 1952 году. Затем - аспирантура, защита кандидатской диссертации, работа ассистентом, доцентом на кафедре детских болезней лечебного факультета родного института. С 1969 года по настоящее время М.Я. Студеникин возглавляет кафедру детских болезней лечебного факультета Российского государственного медицинского университета.
С 1960 года М.Я. Студеникин руководит Институтом педиатрии АМН СССР. В 1966 году защищает докторскую диссертацию, получает звание профессора. Незаурядные способности, тонкое научное чутье и богатый клинический опыт позволили ему на посту директора института провести огромную научно-организационную работу. Были развернуты новые современно оснащенные клиники и лаборатории, расширена работа по подготовке научных кадров, по ряду наиболее актуальных и новых проблем педиатрии, таких, как неонатология, аллергология, гематология, клиническая вирусология, иммуноцитология, экогенные болезни детского возраста, проводились углубленные научные исследования.
Под руководством Митрофана Яковлевича Институт педиатрии АМН СССР достиг больших успехов в развитии науки и внедрении ее достижений в практику детского здравоохранения, за что был награжден орденом Ленина, а работы ученых института отмечены Ленинской и Государственной премиями.
Деятельность М.Я. Студеникина активно способствовала превращению Института педиатрии РАМН в наиболее крупное в стране научное учреждение педиатрического профиля, которое как головное осуществляет планирование и координацию основных научных исследований по педиатрии в стране. Советом по грантам Президента Российской Федерации Институт педиатрии РАМН признан ведущей научной школой.
Диапазон научных интересов М.Я. Студеникина весьма широк. Его научные работы посвящены приоритетным проблемам педиатрии - сосудистым дистониям, неонатологии, питанию детей разного возраста, заболеваниям печени и желчных путей, почек, крови, мусковисцидозу, аллергическим болезням, социальным вопросам педиатрии. Он является автором более 250 научных работ, среди которых 10 монографий и 40 глав в коллективных монографиях, руководствах, справочниках и сборниках. Под его редакцией выпущено 20 руководств для врачей и 4 издания "Справочника педиатра", ставшего настольной книгой многих врачей.
Профессор М.Я. Студеникин является заведующим кафедрой детских болезней лечебного факультета Российского государственного медицинского университета. Под его руководством и при консультировании выполнено 56 докторских и свыше 70 кандидатских диссертаций. Его ученики в настоящее время занимают руководящие посты в органах здравоохранения, возглавляют научно-исследовательские учреждения, кафедры медицинских институтов, руководят клиниками и лабораториями научно-исследовательских институтов.
Большая работа, проводимая Митрофаном Яковлевичем, по научному сотрудничеству с педиатрическими учреждениями целого ряда стран, значительное число публикаций за рубежом снискали ему заслуженное признание. В 1971 году Митрофан Яковлевич избирается членом-корреспондентом АМН СССР и действительным членом АМН СССР (ныне РАМН) — в 1975 году.
М.Я. Студеникин - действительный член Международной академии творчества, почетный член научных обществ педиатров 11 европейских стран и Американской академии педиатрии, почетный доктор университетов в Хельсинки, Будапеште и Ростоке.
Он — президент Московского детского фонда, председатель Научного совета по педиатрии РАМН, длительное время председатель правления Научного общества педиатров России, эксперт Комитета служб охраны материнства и детства Всемирной организации здравоохранения, член Постоянного комитета Международной педиатрической ассоциации, член редколлегии журналов "Педиатрия", "Здоровье", "Acta paediatrica japonica". Более 20 лет он является председателем Общества дружбы с народами Кипра. Избирался народным депутатом СССР.
Супруга - Студеникина Лидия Ивановна (1933 г. рожд.), врач-педиатр, кандидат медицинских наук, доцент. Дочь - Студеникина Ирина Митрофановна (1958 г. рожд.). Сын - Студеникин Владимир Митрофанович (1962 г. рожд.).
Заслуженный деятель науки РФ, академик РАМН, доктор медицинских наук, профессор, Почетный директор Института педиатрии РАМН.
Удостоен почетного звания Заслуженного деятеля науки РФ. Награжден орденами Октябрьской Революции, Трудового Красного Знамени, Отечественной войны I и II степени, Красной Звезды, Дружбы народов, "За заслуги перед Отечеством" IV степени, медалями "За отвагу", "За боевые заслуги", "За заслуги перед отечественным здравоохранением" и 4 почетными знаками. За многолетнюю заботу о нуждах детей Патриархом Московским и всея Руси Алексием II он награжден орденом Святого Даниила князя Московского, орденом Святого Владимира.